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KASP SNP基因分型技术介绍
来源:Genenode|君诺德公司     发布时间:2017-12-26     Hits:3376


单核苷酸多态性
(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指由于单个核苷酸碱基的改变而导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象,这就是SNP。
 由于SNP在人类基因组中数量较多,发生频率较高,因此被认为是继微卫星之后的新一代遗传学标记,在医学遗传学、药物遗传学、疾病遗传学、疾病诊断学、以及人类进化等研究领域都有着很高的研究价值和应用前景。


KASP SNP技术原理
KASP方法即Kompetitive Allele-Specific PCR(竞争性等位基因特异性PCR),可以用2个荧光探针、2个通用淬灭探针,再加多个位点特异探针来检则多个SNP位点,这项技术是基于引物末端碱基的特异匹配来对SNP分型以及检测InDels (插入和缺失)。原理上类似Taqman检测,也是基于终端荧光读取判断,每孔采用双色荧光检测一个样本的一个位点可能的两种基因型,而KASP技术与Taqman技术不同的是,它不需要每个SNP位点都去合成特异的荧光引物,它基于自己独特的ARM PCR原理,让所有的位点检测最终都使用通用荧光引物扩增,这大大降低了LGC KASP的试剂成本,既有金标准的准确,又降低了使用成本,比Taqman还具有更好的位点适应性,所以在医学、农学检测方面KASP都有非常好的应用,尤其适用于大量样本,大量位点的检测,检出率高,准确性好。

技术特点:高通量,简单,灵活,准确率高,检出率好!
分型结果准确,准确度>99.8%
 基于终端荧光读取判断,每孔采用双色荧光检测一个样本的一个位点可能的两种基因型,不同的SNP模板对应不同的荧光产物。
 检测成本低
 不需要每个SNP位点都去合成特异的荧光引物,它基于自己独特的ARM PCR原理,让所有的位点检测最终都使用通用荧光引物扩增,这大大降低了试剂成本。合成的探针可用于上千样本的检测。
 节省样品
 对样本质量要求没那么高,每个SNP检测仅需样本1-10ng DNA (根据人类基因组大小测算)。
 检测时间短,检测通量高
 全自动的工作平台及超大通量,使得实验最短的时间内完成检测,,灵活采用 96 孔板、384 孔板,甚至是 1536 孔板,一天可检测八万个以上 SNP 位点;检测体积低至 1μL,且仅采用常规引物探针即可完成实验,大大降低检测成本。
 一站式服务
 从提供生物样本开始,进行探针设计、DNA抽提、检测到分析结果,提供省心省力的一站式服务。

成本最低,准确率高,检出率好的SNP分型方法:
 基因分型费用2.5-3元/位点,引物探针设计合成费用:200-300元/位点。

客户需提供
  • 细胞,组织或血液等样品材料,基因组DNA提取费用单独收费; 
  • 基因组DNA(体积≥30μl,浓度≥50 ng/μl),纯度 OD260/280 为1.7~1.9之间; 
  • 人类基因组需提供SNP位点的RS号。其它物种如牛、鸡、鱼等无rs号的,需提供SNP位点上下游各200bp的确切序列,SNP位点的突变类型,以及位点的上下游25bp内是否存在其它连锁位点。
最终提交结果
  • SNPs结果(ExceL表格); 
  • 2. 完整实验报告:扩增和反应体系、所涉及的引物、探针序列;


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