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分光光度值与核酸浓度的换算
1 A260 unit dsDNA=50 μg/ml
1 A260 unit ssDNA=33 μg/ml
1 A260 unit ssRNA=40 μg/ml
蛋白质质量与摩尔数的转换
100 pmol的100 kDa蛋白分子=10 μg
100 pmol的50 kDa蛋白分子=5 μg
100 pmol的10 kDa蛋白分子=1 μg
100 pmol的1 kDa蛋白分子=100 ng
DNA分子质量与摩尔数
1 μg of 1000 bp DNA = 1.52 pmol(3.03 pmol of ends)
1 μg of pBR322 DNA = 0.36 pmol DNA
1 pmol of 1000 bp DNA = 0.66 μg
1 pmol of pBR322 DNA = 2.8 μg
蛋白质/DNA之间的转换
1 kb的DNA可编码333个氨基酸=37 kDa的蛋白分子
270 bp的DNA= 10 kDa的蛋白分子
9个氨基酸=1 kDa的蛋白分子
810 bp的DNA= 30 kDa的蛋白分子
2.7 kb的DNA= 100 kDa的蛋白分子
DNA分子质量与摩尔数的换算公式
对于dsDNA 分子
将pmol转换为μg
pmol×N×(660 pg/pmol)×(1 μg/106pg) = μg
将μg转换为pmol
μg×(106pg/1 μg)× (pmol/660 pg)×(1/N) = pmol
其中 N 是核酸碱基对数，660 pg/pmol 是每对碱基的平均分子量(MW)。
一个氨基酸的平均分子量=100 Daltons(道尔顿)
Daltons(Da) kilo是原子质量单位的另一名称，千道尔顿
Dalton (kD)即为1000 道尔顿 。因此，质量为46 kD的蛋白质是每摩尔分子46000克的分子。
对于ssDNA 分子
将pmol转换为μg
pmol×N×(330 pg/pmol)×(1 μg/106pg) = μg
将μg 转换为pmol
μg×(106pg/1 μg)×(pmol/330 pg)×(1/N) = pmol
其中 N 是核酸碱基数，330 pg/pmol 是每个碱基的平均分子量(MW)。
同位素, 酸、碱, 蛋白质数据
(Isotope Data, Acids & Bases, Protein Data)
同位素数据
|
同位素 |
释放的微粒 |
半衰期 |
|
14C |
b |
5,730 years |
|
3H |
b |
12.3 years |
|
125I |
g |
60 days |
|
32P |
b |
14.3 days |
|
33P |
b |
25 days |
|
35S |
b |
87.4 days |
|
1 Ci |
= |
1,000 mCi |
|
1 mCi |
= |
1,000 µCi |
|
1 µCi |
= |
2.2 X 106 disintegrations/minute |
|
1 Becquerel |
= |
1 disintegration/second |
|
1 µCii |
= |
3.7 X 104 Becquerels |
|
1 Becquerel |
= |
2.7 X 10-5 µCi |
酸、碱
|
酸或碱 |
分子式 |
分子量 |
比重 |
质量百分比 |
C克分子浓度 |
|
冰醋酸 |
CH3COOH |
60.0 |
1.05 |
99.5 |
17.4 |
|
甲酸 |
HCOOH |
46.0 |
1.20 |
90 |
23.4 |
|
盐酸 |
HCl |
36.5 |
1.18 |
36 |
11.6 |
|
硝酸 |
HNO3 |
63.0 |
1.42 |
71 |
16.0 |
|
高氯酸 |
HClO4 |
100.5 |
1.67 |
70 |
11.6 |
|
磷酸 |
H3PO4 |
98.0 |
1.70 |
85 |
18.1 |
|
硫酸 |
H2SO4 |
98.1 |
1.84 |
96 |
18.0 |
|
氢氧化氨 |
NH4OH |
35.0 |
0.90 |
28 |
14.8 |
|
氢氧化钾 |
KOH |
56.1 |
1.52 |
50 |
13.5 |
|
氢氧化钠 |
NaOH |
40.0 |
1.53 |
50 |
19.1 |
|
β-巯基乙醇 |
HSCH2CH2OH |
78.1 |
1.11 |
100 |
14.3 |
蛋白质
菌种: E. coli 或 Salmonella typhimurium
|
细胞 |
每个细胞 |
每升培养体系（109细胞/ml） |
|
湿重 |
9.5 X 10-13 g |
0.95 g |
|
干重 |
2.8 X 10-13 g |
0.28 g |
|
总蛋白 |
1.55 X 10-13 g |
0.15 g |
|
体积 |
1.15 µm3 = 1 femtoliter |
|
|
每个细胞中的蛋白浓度: 135 mg/ml |
||
|
1升培养体系（109细胞/ml）中所产生的目标蛋白的理论值: |
||
核苷酸的物理特性
(Nucleotide Physical properties)
|
核苷酸 |
分子量 |
吸收波长λ max (pH 7.0) |
在λ max 处的吸光度 |
|
ATP |
507.2 |
259 |
15,400 |
|
CTP |
483.2 |
271 |
9,000 |
|
GTP |
523.2 |
253 |
13,700 |
|
UTP |
484.2 |
262 |
10,000 |
|
dATP |
491.2 |
259 |
15,200 |
|
dCTP |
467.2 |
271 |
9,300 |
|
dGTP |
507.2 |
253 |
13,700 |
|
dTTP |
482.2 |
267 |
9,600 |
核酸数据
(Nucleic Acid Data)
一个DNA碱基对（钠盐）的平均分子量 = 650 道尔顿
1.0 A260 unit ds DNA = 50 µg/ml = 0.15 mM (in nucleotides)
1.0 A260 unit ss DNA = 33 µg/ml = 0.10 mM (in nucleotides)
1.0 A260 unit ss RNA = 40 µg/ml = 0.11 mM (in nucleotides)
双链DNA分子的分子量(道尔顿) = 碱基对数目×650
双链DNA分子的末端摩尔数 = 2 ×DNA质量（克）/ DNA分子量（道尔顿）
限制性内切酶酶切后的DNA末端摩尔数:
a) 环状DNA分子: 2 × DNA摩尔数× 位点数
b) 线性DNA分子: 2 × DNA摩尔数×位点数 + 2 × DNA摩尔数
1 µg 1000 bp DNA = 1.52 pmol = 9.1 × 1011 molecules
1 µg pUC18/19 DNA (2686 bp) = 0.57 pmol = 3.4 × 1011 molecules
1 µg pBR322 DNA (4361 bp) = 0.35 pmol = 2.1 × 1011 molecules
1 µg M13mp18/19 DNA (7249 bp) = 0.21 pmol = 1.3 × 1011 molecules
1 µg λDNA (48502 bp) = 0.03 pmol = 1.8 ×1010 molecules
1 pmol 1000 bp DNA = 0.66 µg
1 pmol pUC18/19 DNA (2686 bp) = 1.77 µg
1 pmol pBR322 DNA (4361 bp) = 2.88 µg
1 pmol M13mp18/19 DNA (7249 bp) = 4.78 µg
1 pmol λDNA (48502 bp) = 32.01 µg
1.0 kb DNA = 333个氨基酸的编码量≈ 37,000 道尔顿蛋白质
10,000道尔顿蛋白质≈270 bp DNA
50,000道尔顿蛋白质≈ 1.35 kb DNA
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