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核酸、蛋白质杂交用相关试剂、缓冲液的配制方法
20×SSC
组份浓度 3.0 MNaCl,0.3 MNa3citrate·2H2O(柠檬酸钠·2H2O)
配制量 1 L
配制方法
1.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
NaCl |
175.3 g |
柠檬酸钠·2H2O |
88.2 g |
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.滴加14 N HCl,调节pH值至7.0后,加去离子水将溶液定容至1 L。
4.高温高压灭菌后,室温保存。
20×SSPE Buffer
组份浓度 3.0 MNaCl,0.2 MNaH2PO4,0.02 MEDTA
配制量 1.L
配制方法
1.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
NaCl |
175.3 g |
NaH2PO4·H2O |
27.6 g |
Na2EDTA·2H2O |
7.4 g |
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加NaOH调节pH值至7.4(约6.5 ml的10 N NaOH)。
4.加去离子水将溶液定容至l L。
5.高温高压灭菌后,室温保存。
50 X Denhardt’S溶液
组份浓度
1%(W/V) |
Ficoll 400(菲可400/水溶性聚蔗糖400) |
1%(W/V) |
Polyvinylpyrrolidone(聚维酮/聚乙烯吡咯烷酮) |
1%(W/V) |
BSA |
配制量 500 ml
配制方法
1.称量下列试剂,置于500 ml烧杯中。
Flcoll 400 |
5 g |
Polyvinylpyrrolidone |
5 g |
BSA |
5 g |
2.加去离子水约400 ml,充分搅拌溶解
3.加去离子水将溶液定容至500 ml。
4.用0.45µm滤膜过滤后,分装成每份25 ml。
5.-20℃保存。
0.5 M 磷酸盐Buffer
组份浓度 0.5 M Na2HPO4。
配制量 l L
配制方法
1.称量134 gNa2HPO4·7H2O置于1 L烧杯中。
2.加入约800 ml的去离子水充分搅拌溶解。
3.加入85%的H3PO4(浓磷酸)调节溶液pH值至7.2。
4.加去离子水定容至1 L。
5.高温高压灭菌后,室温保存。
Salmon DNA (鲑鱼精DNA)
组份浓度 10 mg/ml Salmon DNA
配制量 约100 ml
配制方法
1.称取鲑鱼精DNA2 g置于500 ml烧杯中,加入约200 ml的TE Buffer。
2用磁力搅拌器室温搅拌2~4h,溶解后加入4ml的5 MNaCl,使其终浓度为0.1 M。
3.用苯酚和苯酚/氯仿各抽提1次。
4.回收水相溶液后,使用17号皮下注射针头快速吸打溶液约20次,以切断DNA。
5.加入2倍体积的预冷乙醇进行乙醇沉淀。
6.离心回收DNA后,溶解于100 ml的去离子水中。测定溶液的OD260值。
7.计算溶液的DNA浓度后,稀释DNA溶液至10 mg/ml。
8.煮沸10min后,分装成小份(1 ml/份)。-20℃保存。
9.使用前在沸水浴中加热5min后,迅速冰浴冷却。
DNA变性缓冲液
组份浓度 1.5 MNaCl,0.5 MNaOH
配制量 1 L
配制方法
1.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
NaCl |
87.7 g |
NaOH |
20 g |
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加去离子水将溶液定容至l L后,室温保存。
预杂交液/杂交液 (DNA杂交用)
组份浓度
6× |
SSC(或SSPE) |
5× |
Denhardt’s |
0.5%(W/V) |
SDS |
100 µg/ml |
Salmon DNA |
配制置 100 ml
配制方法
1.称量下列试剂,置于200 ml烧杯中。
20×SSC(或SSPE) |
30 ml |
50×Denhardt’s |
10 ml |
10% SDS |
5 ml |
10 mg/ml Salmon DNA |
1 ml |
dH2O |
54 ml |
2.充分混匀后,使用0.45 µm滤膜滤去杂质后使用。
预杂交液/杂交液(RNA杂交用)
组份浓度
6× |
SSC(或SSPE) |
5× |
Denhardt‘s |
0.5%(W/V) |
SDS |
100 g/ml |
Salmon DNA |
50%(V/V) |
Formamlde(甲酰胺) |
配制量 100 mL
配制方法
1.称量下列试剂,置于200 ml烧杯中。
20×SSC(或SSPE) |
30 ml |
50×Denhardt’s |
10 ml |
10% SDS |
5 ml |
10 mg/ml Salmon DNA |
1 ml |
Formamide(甲酰胺) |
50 ml |
dH2O |
4 ml |
2.充分混匀后,使用0.45µm滤膜滤去杂质后使用。
膜转移缓冲液(Western杂交用)
组份浓度 39 mMGlycine,48 mMTris,0.037%(W/V)SDS,20%(V/V)甲醇
配制量 1 L
配制方法
1.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
Glycine |
2.9 g |
Tris |
5.8 g |
SDS |
0.37 g |
2.向烧杯中加入约600 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加去离子水将溶液定溶至800 ml后,加入200 ml的甲醇。
4.室温保存。
TBST Buffer(Western杂交膜清洗液)
组份浓度 20 mMTris-HCl,150 mMNaCl,0.05%(V/V)Tween 20
配制量 1 L
配制方法
1.称量下列试剂,置于l L烧杯中。
NaCl |
8.8 g |
1 MTris-HCl(pH8.0) |
20 ml |
2.向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3.加入0.5 ml Tween 20后充分混匀。
4.加去离子水将溶液定容至l L后,4℃保存。
封闭缓冲液(Western杂交用)
组份浓度 5%(W/V)脱脂奶粉/TBST Buffer
配制量 100 ml
配制方法
1.称5 g脱脂奶粉加入到100 ml TBST Buffer中,充分搅拌溶解。
2. 4℃保存待用(本封闭液应该现配现用)。
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