高通量DNA测序技术为分析抗体基因序列, 特别是针对大容量、多样性高的抗体基因库序列的系统分析提供了可能。
对测序得到的原始数据(Raw reads)进行质量控制,滤掉质量低与长度短的读段并获得干净的数据(Clean reads);利用IgBlast和 IMGT对抗体的可变区进行V(D)J生殖系基因定位(VDJ annotation);根据生殖系基因定位将每个合并的读段剪切至恰好包含整个可变区域;去除冗余数据,对于每个唯一读段(Unique reads)记录其总数量;系统化注释获得 reads 的可变区域并提取CDR3区域;分析CDR3区域并获得抗体的家系信息(Clone or lineage);获得每个家系中轻重链可变区域的序列特性,并利用重链和轻链各家系的reads数量进行轻重链配对;对配对好的抗体序列通过实验验证功能。
服务优势:
1.采用RACE技术和专门优化的PCR扩增体系与程序,真实体现免疫系统发育过程
2.多样化的NGS分析平台
3.成功率高与快速交付速度
4.完备的生物信息学分析,深度挖掘高价值信息
应用方向:
1.开发高亲和力抗体
2.缩短单克隆抗体开发周期
服务内容:
客户提供:
免疫原相关信息
交付内容:
1. NGS测序数据
2. 生物信息学数据分析结果
3. 重组抗体的序列信息与构建
4. 重组抗体的验证结果
4. 实验周期3-5个月