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细菌16S rDNA菌种鉴定
菌种鉴定有多种方法,而通过DNA测序鉴定的方法被誉为金标准。DNA 测序进行菌种鉴定的结果比传统生化鉴定更为直接,鉴定结果也更为可靠。核糖体RNA(rRNA)是生物细胞中主要的核糖核酸之一。rRNA分子的一级结构既具有高度保守性区域,又具有高度变化特异性区域。保守区域反映了生物物种间的亲缘关系,可用于构建生命统一进化树,而高度变化特异区域则能表明物种间的差异,可用于区别属或者种。
细菌具有5S, 16S, 23S三种rRNA,其中5S rRNA序列较短,包含的细菌遗传信息量少,不适合用于分析鉴定细菌种类,而23S rRNA序列较长,且碱基突变速率要比16S rRNA快得多,不适用对较远亲缘关系的细菌进行鉴定。16S rRNA其大小约1500 bp ,所代表的细菌遗传信息量适中,是进行细菌分类研究的理想材料。
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