禽类血液DNA提取试剂盒(离心柱型)
Poultry Blood gDNA Extraction Kit(SpinColumn)
一.试剂盒组成、储存、稳定性:
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Contents
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Storage
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A1606-50
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A1606-100
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A1606-200
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50T
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100T
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200T
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平衡液
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室温
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5 mL
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10 mL
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20 mL
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缓冲液Buffer BB
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室温
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10 mL
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20 mL
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40 mL
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结合液Buffer CB
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室温
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15 mL
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30 mL
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60 mL
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抑制物去除液Buffer IR
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室温
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25 mL
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50 mL
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100 mL
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漂洗液Buffer WB
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室温
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15 mL
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25 mL
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50 mL
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第一次使用前按说明加指定量乙醇
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洗脱缓冲液Buffer EB
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室温
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15 mL
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15 mL
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2 x 15 mL
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蛋白酶K粉20mg/mL
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-20℃
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20 mg
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2 x 20 mg
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4 x 20 mg
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吸附柱Spin AC
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室温
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50
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2 x 50
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4 x 50
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收集管(2mL)
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室温
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50
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2 x 50
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4 x 50
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备注:新货号A1606,旧货号D2506。
二.保存条件:
本试剂盒在室温(15°C-25°C)干燥条件下可保存12个月,Proteinase K (20mg/mL)需单独-20℃低温保存。
三.自备试剂:
无水乙醇,异丙醇,台式高速离心机,水浴锅。
四.产品简介:
独特的结合液/蛋白酶K迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸酶,然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。
五.产品特点:
1.不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
2.快速,简捷,单个样品操作一般可在20分钟内完成。
3.多次柱漂洗确保高纯度,典型的产量200 µL全血可提取出3-12 µg,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9,长度可达30 kb -50 kb,可直接用于PCR、Southern-blot和各种酶切反应。
4.从十几个配方中优选出的红细胞裂解液配方,裂解快速完全,客户可根据需要选择购买。
5.典型的产量200 µL全血可提取出3-12 µg基因组DNA。
六.适用范围:
适用于快速提取禽类血液基因组DNA。
七.储存条件:
1.结合液Buffer CB或者抑制物去除液Buffer IR低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。
2.为避免降低活性,方便运输,提供蛋白酶K为冻干粉状,收到后,可短暂离心后,加入1毫升灭菌水溶解。因为反复冻融可能会降低酶活性,因此溶解后立即按照每次使用量分装冻存,-20℃保存。
3.避免试剂长时间暴露于空气中发生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
八.注意事项:
1.所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000 rpm的传统台式离心机,如Eppendorf 5415C或者类似离心机。
2.不同样品尤其疾病样品中白细胞数量差异可能非常大,因此产量的个体差异也可能非常大。
3.需要自备异丙醇。
4.开始实验前将需要的水浴先预热到70℃备用。
5.为了最佳效果,最好使用新鲜血液标本或者4℃存放少于3天的标本,不要使用反复冻融超过3次的标本,否则会严重降低产量。
6.洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确保批pH大于7.5,pH过低影响洗脱效率。用水洗脱DNA应该保存在-20℃。DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱(10mM Tris-HCl,1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能下游酶切反应,使用时可以适当稀释。
7.关于平衡液的使用:
1)介绍:核酸吸附硅胶膜柱子长期放置过程中会同空气中的电荷/尘埃发生反应而影响其核酸的结合能力。硅胶柱经平衡液预处理后可大大减少柱子中硅胶膜的憎水基团,提高核酸的结合能力。从而提高硅胶柱子回收效率或者产量。平衡液是强碱性溶液,若不小心碰到,请用大量自来水清洗。用完后需盖紧瓶盖,以免接触空气。室温保存。在保存过程中可能有沉淀生成,请加热至37℃使沉淀完全消失。
2)使用方法:取一个新的硅胶膜吸附柱子装在收集管中,吸取100 µL的平衡液至柱子中。13,000 rpm离心1分钟,倒掉收集管中废液,将吸附柱子重新放回收集管。此时平衡液预处理柱子完毕。接后续的操作步骤。
九.操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)
提示:第一次使用前请先在漂洗液Buffer WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
1.针对禽类、鸟类、两栖类或更低级生物的抗凝血液,其红细胞为有核细胞,因此血液处理量只需加入5-20 µL,可加缓冲液Buffer BB补足到200 µL。
2.加入20 µL蛋白酶K (20mg/mL)溶液,充分混匀,再加入200 µL结合液Buffer CB,立刻涡旋振荡充分混匀,在70℃放置10分钟。溶液应变清亮(但颜色偏黑色)。
可选步骤,一般不需要:如果RNA残留较多,需要去除RNA,可以在加入200 µL结合液Buffer CB前加20 µL RNase A(25mg/mL)溶液,振荡混匀,室温放置5-10分钟。
平衡液预处理吸附柱备用:
使用平衡液预处理硅胶膜吸附柱为必做步骤,具体方法参见前文“关于平衡液的使用”
3.冷却后加入100 µL异丙醇,立刻涡旋振荡充分混匀,此时可能会出现絮状沉淀。
上述步骤中立刻涡旋或者吹打充分混匀非常重要,混匀不充分严重降低产量,必要时如样品粘稠不易混匀时可以涡旋振荡15秒混匀。
4.将上一步混合物(包括可能有的沉淀)加入一个吸附柱Spin AC中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm离心30-60秒,倒掉收集管中的废液。
5.加入500 µL抑制物去除液Buffer IR,12,000 rpm离心30秒,弃废液。
6.加入600 µL漂洗液Buffer WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000 rpm离心30秒,弃掉废液。
7.加入600 µL漂洗液Buffer WB,12,000 rpm离心30秒,弃掉废液。
8.将吸附柱Spin AC放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
9.取出吸附柱Spin AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100 µL洗脱缓冲液Buffer EB(洗脱缓冲液事先在65-70℃水浴中预热效果更好),室温放置3-5分钟,12,000 rpm离心1分钟。将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2分钟,12,000 rpm离心1分钟。
洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积,但是最小体积不应少于50 µL,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。
10.DNA可以存放在2-8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃。
十.问题与解决方法:
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问题
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评论与建议
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标本中含有血凝块
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*不恰当的存放标本,未充分混匀,未使用合适的抗凝剂-建议:丢弃有血凝块的标本,重新用EDTA,肝素,柠檬酸剂收集血液。
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红细胞裂解不完全
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*血液标本裂解前没有回复到室温-建议:处理前先把血液标本回复到室温。
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*裂解时间不够-建议:可延长裂解时间至15分钟以上。
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*裂解过程中没有混匀-建议:裂解过程中可以更多次颠倒混匀,或者轻弹管壁帮助裂解。
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DNA产量低
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*血液标本中本身含有的白细胞数量低-建议:增加起始血液处理量。
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*血液标本存放时间太长-建议:存放在4℃的血液标本超过5天的产量可能大大降低,因此不要存放太久。
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*蛋白酶K失效了-建议:收到蛋白酶K后,按照每次使用量分装冻存,避免反复冻融。
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*裂解不完全或者和异丙醇没有充分混匀-建议:加入结合液后,和加入蛋白酶K后立即吹打或者涡旋混匀;加入异丙醇后立即吹打或者涡旋混匀才加入吸附柱,如果太粘稠必须涡旋振荡15秒充分混匀。
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*洗脱效率不高-建议:确保做了步骤8,否则残留乙醇会影响洗脱效率,仔细阅读仔细阅读注意事项6和步骤9和只使用洗脱缓冲液Buffer EB洗脱。
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DNA下游酶切不能切开或者酶切不完全
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*忘记做步骤8,乙醇抑制了酶切反应-建议:做步骤8,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。
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*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000 rpm再离心一分钟,小心取上清使用。
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DNA长度小于15kb
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*血液样品太老或者不正确的存放,造成DNA降解-建议:选用新鲜的血液样品
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*操作不当,造成对基因组DNA的剪切-建议:混匀时不可太剧烈,不可以用手剧烈振荡离心管,选用大口径的枪头转移或者混匀DNA。
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A260吸光值异常偏高
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*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了吸光值-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000 rpm再离心一分钟,小心取上清使用。
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洗脱下来的DNA溶液还带有轻微的颜色
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*漂洗不完全-建议:1.漂洗,直到离心下来的液体没有颜色;2.将洗脱液当成起始材料,再重复一遍实验,注意略去蛋白酶K消化和70℃孵育步骤。
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