支原体DNA提取试剂盒(离心柱型)
Mycoplasma DNA Extraction Kit(SpinColumn)
一.试剂盒组成、储存、稳定性:
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试剂盒组成
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保存
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D2533-50
50T
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D2533-100
100T
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缓冲液Buffer PE
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室温
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65 mL
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2 x 65 mL
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缓冲液Buffer RB
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室温
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30 mL
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60 mL
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结合液Buffer CB
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室温
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11 mL
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20 mL
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抑制物去除液Buffer IR
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室温
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25 mL
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50 mL
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漂洗液Buffer WB
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室温
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15 mL
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25 mL
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第一次使用前按说明加指定量乙醇
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洗脱缓冲液Buffer EB
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室温
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15 mL
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15 mL
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蛋白酶20mg/mL
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-20℃
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20 mg
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2 x 20 mg
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Poly Carrier
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-20℃
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200 μL
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2 x 200 μL
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吸附柱Spin AC
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室温
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50
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100
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收集管(2mL)
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室温
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50
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100
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本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。
二.产品简介:
本试剂盒专为支原体(无细胞壁原核微生物)基因组DNA提取设计,基于硅基质膜特异性吸附核酸的原理,结合支原体细胞膜的结构特点,优化裂解体系与操作条件。独特的Buffer RB与蛋白酶K协同作用,可高效裂解支原体细胞膜(无需溶菌酶),快速释放胞内环状双链基因组DNA并灭活核酸酶;在高离序盐状态下,支原体DNA选择性吸附于离心柱内优质硅基质膜,通过抑制物去除液Buffer IR和漂洗液Buffer WB的两次漂洗,彻底去除细胞代谢物、膜蛋白、杂质及残留酶类;最后用低盐洗脱缓冲液Buffer EB将纯净的支原体基因组DNA从硅基质膜上洗脱,获得高纯度、高得率的DNA产物,可直接用于下游PCR、qPCR、测序、酶切等实验。
三.产品特点:
1.适配性强:吸附柱内硅基质膜经特殊优化,可高效吸附支原体小分子基因组DNA(避免穿滤丢失),柱与柱之间吸附量差异极小,重复性好。
2.安全便捷:无需使用苯酚、氯仿等有毒试剂,无需额外乙醇沉淀步骤,操作简单,单个样品全程可在40~60min内完成。
3.高得率优化:针对支原体无细胞壁、DNA拷贝数低的特点,优化裂解条件与洗脱方式,大幅提升支原体DNA回收效率,低拷贝样本(如细胞培养污染检测)得率可提升3~10倍。
4.高纯度保障:多次漂洗步骤有效去除蛋白、内毒素、盐离子等杂质,提取的DNA OD260/OD280典型比值达1.7~1.9,片段完整性好,可直接满足各类下游分子生物学实验需求。
5.通用性广:可适配各类支原体(如肺炎支原体、解脲支原体等),适用于纯支原体培养物、细胞培养污染样本、临床复杂样本(痰液、泌尿拭子等)的DNA提取。
四.适用范围:
适用于快速提取各类支原体的基因组DNA,包括但不限于:
1.纯支原体培养物(液体/固体培养);
2. 细胞培养体系(上清液/细胞沉淀,用于支原体污染检测);
3. 临床样本(痰液、鼻咽拭子、泌尿生殖道拭子、组织匀浆等);
4. 环境样本(水样、土壤样本中的支原体)。
五.储存条件:
1.结合液Buffer CB或者抑制物去除液Buffer IR低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。
2.为避免降低活性,方便运输,提供蛋白酶K为冻干粉状,收到后,可短暂离心后,加入1毫升灭菌水溶解,因为反复冻融可能会降低酶活性,因此溶解后立即按照每次使用量(20微升)分装冻存,-20℃保存。
3.避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
六.注意事项:
1. 所有试剂使用前请恢复至室温,涡旋混匀,避免试剂分层影响实验效果;Buffer RB、Buffer CB若出现沉淀,可37℃水浴溶解后使用,不影响实验。
2. 蛋白酶K溶液需在-20℃保存,避免反复冻融,使用后立即放回低温环境,失效的蛋白酶K会导致裂解不充分,严重降低得率。
3. 漂洗液Buffer WB必须加入无水乙醇后才能使用,未加乙醇会导致支原体DNA无法被有效洗涤,残留杂质影响下游实验。
4. 支原体无细胞壁,严禁加入溶菌酶,溶菌酶对支原体无作用靶点,不仅无效,还会引入蛋白杂质,降低DNA纯度。
5. 样本处理过程中,离心转速和时间需严格按照步骤要求操作,支原体菌体微小,转速过低、时间过短会导致菌体无法有效沉淀,造成DNA丢失。
6. 操作过程中避免手套接触吸附膜,防止蛋白污染,影响核酸吸附;所有离心管、枪头需使用无菌无酶产品,避免DNA酶污染导致核酸降解。
7. 洗脱缓冲液EB为低盐缓冲液,若后续实验需要高盐环境,可在洗脱后进行乙醇沉淀调整;若无需调整,可直接用于PCR、qPCR等实验。
8. 试剂盒有效期见试剂瓶标签,过期试剂请勿使用;试剂储存请严格按照说明书要求,避免高温、强光直射。
七.操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)
提示:第一次使用前请先在漂洗液Buffer WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
第一步:样本预处理,富集支原体菌体,减少杂质干扰,提升得率。
1. 纯支原体培养物(高浓度):取0.5~2 mL培养菌液(不超过2×109个支原体),12000 rpm离心15min(支原体菌体微小,需提高转速和时间),尽可能吸弃上清,收集菌体沉淀。
2. 细胞培养上清(支原体污染检测,最常用):取1~5 mL细胞培养上清,加入1/4体积的Buffer PE,4℃静置30min,12000 rpm离心15min,弃上清,收集支原体沉淀(此步骤可大幅富集支原体,提升得率)。
3. 细胞沉淀(支原体污染检测):取1×106~1×107个细胞沉淀,加入200μL Buffer RB,涡旋振荡重悬,10000 rpm离心30秒,弃上清,保留细胞沉淀(支原体附着于细胞表面,此步骤去除细胞代谢杂质)。
4. 临床复杂样本(痰液、拭子、组织匀浆):将样本充分匀浆后,取1 mL匀浆液,12000 rpm离心10min,弃上清,沉淀用200μL Buffer RB重悬,重复离心1次,弃上清,收集沉淀;若样本粘液较多,可在重悬时加入5 μL DTT二硫苏糖醇(客户自备),涡旋混匀,室温放置10min,再离心弃上清。
注意:起始样本量可根据支原体密度调整,吸附柱最大吸附能力为20 μg基因组DNA,菌体过量会导致吸附饱和,严重降低得率。
第二步:菌体裂解(核心优化步骤,提升DNA释放效率)
1. 向第一步收集的支原体沉淀中,加入180 μL缓冲液Buffer RB,涡旋振荡或吹打充分重悬,确保沉淀完全分散(无结块)。
2. 加入30~40μL蛋白酶K溶液(20mg/mL,相较于常规细菌提取加倍,支原体细胞膜蛋白与核酸结合紧密,需增加用量),充分涡旋混匀。
3. (可选步骤:若需去除RNA残留,加入4 μL RNase A(100mg/mL,客户自备)溶液,涡旋混匀,室温放置5~10min)。
4. 加入200μL结合液Buffer CB,立刻涡旋振荡15秒充分混匀,56~70℃水浴孵育30-60min(延长孵育时间,确保支原体细胞膜彻底裂解,释放DNA;中间可取出涡旋混匀1~2次,提升裂解效果)。
注意:支原体无细胞壁,无需添加溶菌酶,添加溶菌酶无效且会引入蛋白杂质。
第三步:DNA结合与杂质去除
1. 将上述裂解混合物冷却至室温,加入100μL异丙醇,立刻涡旋振荡15秒充分混匀,此时可能出现絮状沉淀(支原体DNA),混匀不充分会严重降低得率。
2. 可选步骤:低拷贝样本(如细胞培养上清、临床微量样本),加入5 μL Poly Carrier,涡旋混匀,辅助DNA沉淀,提升得率。
3. 将上一步混合物(包括可能有的沉淀)全部加入一个吸附柱Spin AC中(吸附柱放入2 mL收集管中),13000 rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管。
4. 向吸附柱中加入500μL抑制物去除液Buffer IR,12000 rpm离心30秒,弃废液,将吸附柱放回收集管(去除样本中的粘液、腐殖酸等抑制物,尤其适用于临床样本)。
5. 向吸附柱中加入600μL漂洗液Buffer WB(请再次检查是否已加入无水乙醇!),12000 rpm离心30秒,弃废液,将吸附柱放回收集管。
6. 重复上一步操作:再加入600μL漂洗液Buffer WB,12000 rpm离心30秒,弃废液,将吸附柱放回收集管(两次漂洗确保去除残留杂质和盐离子)。
第四步:DNA洗脱与保存
1. 将吸附柱Spin AC放回空的收集管中,13000 rpm离心2min,尽量除去吸附柱中残留的漂洗液,避免残留乙醇抑制下游PCR、酶切等反应。
2. 取出吸附柱Spin AC,放入一个干净的1.5 mL离心管(自备)中,在吸附膜的中间部位加入50~100μL洗脱缓冲液Buffer EB (洗脱缓冲液事先在65~70℃水浴中预热,可提升洗脱效率),室温放置3~5min。
3. 12000 rpm离心1min,收集洗脱液;将得到的洗脱液重新加入该吸附柱中,室温放置2min,12000 rpm离心1min(重复洗脱,提升DNA得率)。
4. 洗脱后的支原体DNA可直接用于下游实验,短期存放(1~7天)可置于2~8℃,长期存放(超过7天)请置于-20℃,避免反复冻融(反复冻融会导致支原体DNA降解)。
注意:洗脱体积越大,洗脱效率越高,但DNA浓度会降低;若需要高浓度DNA,可将洗脱体积调整为30~50μL(最小不低于30μL,否则会降低洗脱效率)。