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直接测序法SNP分型(PCR-测序法)

直接测序法SNP分型(PCR-测序法)

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技术原理:对欲检测片段进行直接PCR扩增、采用ABI 3730xl DNA测序仪测序,纯合型SNP位点的测序峰为单一峰型,而杂合型SNP位点的测序峰为套峰,因而很容易将其区分开来,通过直接测序方法进行SNP检测的检出率接近100%。测序分型主要通过直接测序的方法来确定位点的基因型,这种分型方法准确性最高,但费用大。如果需要检测的几个SNP位点正好位于一个测序单元内(长度小于700bp),则单个位点的分型费用可显著降低,这种分型技术不失为一种良好选择。对于准确性要求特别高或样本量特别小(几个或几十个)的项目,这种分型技术非常适合。


实验流程:


实验结果示意图:

1.2 服务内容:

1. 样品基因组DNA提取    需收取核酸提取费用
2. 引物设计及合成         仅收取引物合成费用
3. PCR扩增及纯化         需收取PCR扩增及纯化费用
4. ABI 3730xl测序         测序费用
5. 数据分析整理         测序峰图分析,SNPs结果和实验报告整理

1.3 适宜范围:
1. 需要检测的几个SNP位点正好位于一个测序单元内(长度小于600bp)的分型项目;
2. 对于准确性要求特别高或样本量特别小(几十个)的分型项目,如对其它SNP分型方法准确性的验证。


订单点击下载:SNP基因分型订单表


1.4 客户需要提供:
1. 细胞,组织或血液等样品材料,基因组DNA提取费用单独收费;
2. 基因组DNA(体积≥30μl,浓度≥50 ng/μl),纯度 OD260/280 为1.7~1.9之间;
3. 人类基因组需提供SNP位点的RS号。其它物种如牛、鸡、鱼等无rs号的,需提供SNP位点上下游各200bp的确切序列,SNP位点的突变类型,以及位点的上下游25bp内是否存在其它连锁位点。

1.5 最终提交结果:
1. SNPs结果(ExceL表格);
2. 完整实验报告:扩增和反应体系、所涉及的引物、探针序列;

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