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KASP SNP基因分型|SNP基因分型

KASP SNP基因分型|SNP基因分型

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技术原理:
KASP-竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele-Specific PCR),该技术是基于引物末端碱基的特异匹配来对SNP分型以及检测InDels (Insertions and Deletions,插入和缺失),采用2个荧光探针、2个通用淬灭探针,再加多个位点特异探针来检测多个SNP位点,采用全自动核酸提取仪、荧光定量PCR平台,灵活采用96孔板、384孔板,一天可检测几万个SNP 位点。

KASP技术原理上类似Taqman检测,也是基于终端荧光读取判断,每孔采用双色荧光检测一个样本的一个位点可能的两种基因型,而KASP技术与Taqman技术不同的是,它不需要每个SNP位点都去合成特异的荧光引物,它基于自己独特的ARM PCR原理,让所有的位点检测最终都使用通用荧光引物扩增,这大大降低了LGC KASP的试剂成本,既有金标准的准确,又降低了使用成本,比Taqman还具有更好的位点适应性,所以在医学、农学检测方面KASP都有非常好的应用。

想咨询了解更多关于KASP收费,请电话或邮件联系我们! service@genenode.com, 18518676727 张昌源


KASP技术特点:
1.优异的准确性
- 独立评价的准确性>99.8% 
- 业内领先的SNP&InDel 分析的转化率(>90%)
2.超强的灵活性
- 设计的高度灵活性带来更高的成功率
- 支持低/中/高通量研究以及单个重复实验
- 对液体处理系统,PCR仪和荧光分析仪等设备有良好的兼容性
3.前所未有的低成本
- 无需昂贵的双色标记探针,同样成本获得两倍数据量
- 最低的DNA样本需求 (根据基因组大小不同只需 0.1-10 ng) 
- 无需全基因组扩增 (Whole Genome Amplification, WGA)

由于KASP实验方案的高度灵活性,其应用也十分广泛,适合于各种基因分型研究,无论是中低通量SNP研发项目,NGS之后的SNP验证,农业种群研究,或者大量种子的生产QC和生物样品库 DNA Biobanking等都是其适用的范围。

实验步骤:

实验结果散点图:


订单点击下载:SNP基因分型订单表


服务内容:根据客户的要求和课题特点,提供一站式SNP基因分型服务
1、课题的设计咨询包括检测位点的筛选;
2、全血和组织样本基因组DNA提取(费用另算);
3、DNA样本的质检;
4、根据样品数量和分型位点数,推荐成本最低的分型方法;
5、SNP分型所用引物的设计、合成与优化;
6、SNP基因分型;
7、分型数据的质量质控;
8、提交实验报告

客户需要提供:
1. 细胞,组织或血液等样品材料,基因组DNA提取费用单独收费;
2. 基因组DNA(体积≥30μl,浓度≥50 ng/μl),纯度 OD260/280 为1.7~1.9之间;
3. 人类基因组需提供SNP位点的RS号。其它物种如牛、鸡、鱼等无rs号的,需提供SNP位点上下游各200bp的确切序列,SNP位点的突变类型,以及位点的上下游25bp内是否存在其它连锁位点。

最终提交结果:
1. SNPs结果(ExceL表格);
2. 完整实验报告:扩增和反应体系、所涉及的引物、探针序列;

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