技术原理:以SNP分型检测为例,在PCR过程中,两个探针能与正向引物和反向引物之间的互补序列特异退火结合。当探针以完整形式存在时,由于能量共振转移,荧光基团只发出微弱荧光。特异的探针与相应的等位基因杂交后,DNA聚合酶发挥5’外切酶活性,把报告荧光基团切割下来,从而发出荧光;而SNP探针的错配形式不会引起切割,无荧光信号。MGB分子结合到DNA螺旋小沟,通过稳定MGB探针/模板提高杂交稳定性,使短至13个碱基的探针获得高错配区分辩别能力。MGB探针包括一个不发荧光的淬灭基团(NFQ),极大消除传统淬灭基团产生的背景荧光,提高信噪比,从而提高检验灵敏性。
原理及流程示意图:
技术优势:
1. 采用最先进的ABI 7900HT系统采用激光扫描并激活96/384孔板每个反应孔的荧光染料,荧光信号通过光栅分光,经过分离的多色荧光同时到达CCD摄像机,实现多色荧光同时检测。
2. 采用ABI 专利技术的TaqMan-MGB 探针:MGB探针包括一个不发荧光的淬灭基团(NFQ),极大消除传统淬灭基团产生的背景荧光,提高信噪比,从而提高检验灵敏性,另外MGB(小沟结合物)增加Tm值,使探针设计产度缩短至约15bp,提高了探针设计的灵活性。
技术特点:
1. 适合位点少,样本通量高的检测,每个位点需要合成一对探针,探针合成费用高;
2. 应用ABI7900、ABI7500定量PCR仪进行定量检测;
3. 操作简便,只需一步 PCR 反应,无须纯化和预处理,直接上机检测;
4. 结果清晰,软件分析结果界面友好,标出每个样本的基因型及荧光强度,非常直观;
适用范围:特别适合样本数量超过1500个以上,位点数量比较少的SNP分型。
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客户需要提供:
1. 细胞,组织或血液等样品材料,基因组DNA提取费用单独收费;
2. 基因组DNA(体积≥30μl,浓度≥50 ng/μl),纯度 OD260/280 为1.7~1.9之间;
3. 人类基因组需提供SNP位点的RS号。其它物种如牛、鸡、鱼等无rs号的,需提供SNP位点上下游各200bp的确切序列,SNP位点的突变类型,以及位点的上下游25bp内是否存在其它连锁位点。
最终提交结果:
1. SNPs结果(ExceL表格);
2. 完整实验报告:扩增和反应体系、所涉及的引物、探针序列;
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